Master 1 Recherche Biomédicale - UE RB14
Informatique Médicale et Technologies de Communication

Cette Unité d'Enseignement (de 9 ECTS) fait partie du Master 1 Recherche Biomédicale

  • Responsable de l'UE RB14 : Florence Zara (LIRIS-ORIGAMI, Lyon 1)
  • Intervenants de cours : A. Bonnard, M. Ducret, T. Bonhoure, J. Matout, N. Noury, G. Talens, E. Reynaud, R. Richert, F. Zara
  • Conditions d'accès à l'UE : Etudiants à partir de la 2ème année des études de Santé
  • Modalité d'inscription : Inscription par internet sur le site applicationbh.univ-lyon1.fr
  • Volume horaire : 72h

  • Objectif de l'UE

    Familiariser les étudiants à la discipline de l'Informatique en apportant dans un premier temps, les connaissances de base sur l'architecture des ordinateurs, le réseau, Internet et la programmation, afin dans un second temps, d'appréhender l'utilisation des nouvelles technologies dans le domaine médical.


    Thématiques abordées

    • Notion de bases en informatique
    • Programmation
    • Apport de la Réalité Virtuelle dans le domaine médical
    • Apport de l'Intelligence Artificielle dans le domaine médical
    • Télémédecine, e-santé : apport et limites
    • Traitement et analyse d'images
    • Méthodes de traitement des signaux physiologiques
    • Création de base de données
    • Création de pages Web
    • Conception et modélisation de Systémes d'information Médicaux
    • Sécurité des Systèmes d'Information médicaux
    • Dossier médical patient
    • Cas pratique : utilisation des technologies numériques en odontologie
    • Aspects légaux liés à la confidentialité, sécurité, intégrité des données médicales informatisées et protection des individus

    Cette UE peut être liée à l'UE RB25 de stage d'initiation à la recherche.

    Les étudiants inscrits en RB14 peuvent faire en plus un stage RB25 en informatique médicale, de 6 crédits ECTS. Ce stage consiste à faire une revue bibliographique d'environ 10 articles publiés dans des revues à comité de lecture sur un sujet de leur choix en informatique médicale. Ces articles sont fournis par leur maitre de stage, qui est l'un des intervenants de leur choix de l'UE RB14 ; l'étudiant peut également proposer des articles. Le stage est validé fin juin par une note >= 10/20 d'un article de synthèse des articles étudiés (article de type "revue de la littérature" de 8 à 10 pages) et de la présentation orale de 15 mn de cette synthèse devant un jury composé de 3 personnes (Maitre de stage, un autre Intervenant de l'UE RB14, Responsable de l'UE RB14).

    Date soutenance : Jeudi ?? juillet 2025 - Salle ?? - Bat. Rockfeller.


    Modalités de contrôle des connaissances (MCC) - UE RB14

    Coefficient : 35% CC (TP-TD), 65% examen final sur papier

    Contrôle Continu (TP-TD) concerne :
    • Intervention de Guilaine Talens - BD et Web
    • Intervention de Timothé Bonhoure - Conception Systèmes d'Information UML, Sécurité des Systèmes d'Information de Santé
    Examen final concerne :
    • Intervention de Guilaine Talens - BD et Web : savoir réaliser un diagramme de classe, et savoir le traduire en modèle relationnel ; savoir écrire des requêtes en SQL sur un modèle relationnel ; savoir réaliser un style de page web en HTML et CSS.
    • Intervention de Timothé Bonhoure - UML : DCU (diagramme de cas d'utilisation) à élaborer, DCL (diagramme de classes) (proposition de diagramme truffé d'erreurs), une question sur la sécurité des SI médicaux, une question sur le dossier Patient.
    Date de l'examen final (session 1) : jeudi 10 avril 2025 - 14h-17h - salle ?? - Rockefeller

    Consignes pour l'examen final (session 1) :
    • Prendre avec vous : carte étudiant + carte d'identité
    • Les documents sont autorisés
    • Tout accès à Internet est interdit
    • Tablette, ordinateur,smartphone, etc. sont interdits

    • Session 2 : oral sur ces 3 parties également
      Remplacement uniquement de la note d'examen papier de la session 1, c'est-à-dire que la note de CC n'est pas modifiée
      Date de la session 2 : jeudi ?? juin 2024 - ?? - salle ??- Rockefeller

    Emploi du temps - année universitaire 2024-2025

    Horaire : Jeudi 14h-18h
    Lieu : salles informatiques du 1er étage du bâtiment principal du domaine Rockefeller, Aile C.

    Emploi du temps détaillé

    Description des enseignements de l'UE RB 14

    • Notion de bases en informatique
    • Intervenant : Florence Zara (MCU, Lyon 1, LIRIS).
      Contenu : Introduction, réseau, web, architecture d'un ordinateur.
      Objectif : apportez aux étudiants les notions de bases en Informatique (réseau, architecture, www) pour mieux appréhender les autres enseignements de l'UE.
      Supports : A noter que ces supports ont été initialement réalisés par l'équipe PCI de l'Université Lyon 1 (JM Moreau, E. Desserée, L. Médini, E. Guillou, F. Zara).

      Supports du CM - Base en Informatique - F. Zara

    • Programmation
    • Intervenant : Florence Zara (MCU, Lyon 1, LIRIS)
      Contenu : De l'idée à la conception d'une application : partir d'un problème, réflexion pour le résoudre, algorithmes qui en découlent, langages de programmation pour traduire l'algorithme, pourquoi plusieurs langages de programmation (C++, Java, JavaScript, etc.). Exercices de programmation simples basés sur l'utilisation de Scratch.
      Objectif : que les étudiants sachent ce que c'est qu'un programme, comprennent comment cela s'implémente, et qu'ils sachent ce qu'il y a derrière (BD, calcul, affichage via navigateur/smartphone/tablette).
      Supports : A noter que le support du CM a été initialement réalisé par l'équipe PCI de l'Université Lyon 1 (JM Moreau, E. Desserée, L. Médini, E. Guillou, F. Zara) et que le support de TP est basé sur celui créé par E. Desserée pour l'UE SUR.

      Supports du CM et TP - Programmation - F. Zara

    • Apport de l'Intelligence Artificielle (IA) dans le domaine médical
    • Intervenant : Emanuelle Reynaud (MCU, Lyon 2, EMC)
      Contenu : "Deep Learning" et applications en santé.
      Objectif : savoir ce que l'IA peut apporter au domaine médical, savoir ce qu'il y a réellement derrière le mot IA.
      Notions en "deep Learning" et réseaux de Neurones artificiels. Illustrations avec des applications dans le domaine de la santé : détection des cancers du sein, l'aide au diagnostic, la détection des signes précoces de maladies neuro-dégénératives.
      Liens : lien 1, lien 2, lien 3.

      Supports du CM - IA - E. Reynaud

    • Télémédecine, e-santé : apport et limites
    • Intervenant : Norbert Noury (PR Lyon 1, INL)

      Supports du CM - Télémédecine, e-santé - N. Noury

    • Traitement et analyse d'images
    • Intervenant : F. Zara (MCU Lyon 1, LIRIS)
      Contenu : Notions de base et notions plus avancées (techniques d'apprentissage) de traitement et d'analyse médicales
      Objectif : Le travail pratique porte sur la mise en oeuvre des techniques de traitement vues en cours.

      Supports du CM - Traitement d'images - F. Zara

    • Création de base de données
    • Intervenant : Guilaine Talens (MCU Lyon 3, IAE)
      Contenu : Conception globale d'une BD. Qu'est-ce qui se passe derrière ? Requêtes, faire des statistiques sur des données. Finalisation applications. Modélisation d'une base de données, requêtes en SQL.

      Supports du CM - BD - G. Talens

    • Création de pages Web
    • Intervenant : Guilaine Talens (MCU Lyon 3, IAE)
      Contenu : Conception générale d'un site web, qu'est-ce qu'il y a derrière un click sur un site web ? lien avec BD (PHP). Faire un site Web en groupe.
    • Apport de la Réalité Virtuelle (RV) dans le domaine médical
    • Intervenant : Florence Zara (MCU, Lyon 1, LIRIS)
      Contenu : Etat de l'art de l'existant (logiciels, dispositifs de RV simulateurs), technologie actuelle, piste pour l'avenir.
      Objectif : savoir ce que la RV peut apporter au domaine médical, comprendre comment sont conçus les systèmes basés sur la RV.

      Supports du CM - RV - F. Zara

    • Utilisation des technologies numériques en odontologie
    • Intervenant : Maxime Ducret (PU-PH odontologie), Raphael Richert (MCU-PH odontologie)
      Contenu : CFAO, empreinte optique, impression 3D en odontologie
    • Méthodes de traitement des signaux physiologiques
    • Intervenant : Jérémie Mattout (CR INSERM, CRNL)
      Contenu : Méthodes de traitement des signaux physiologiques
    • Aspects légaux liés à la confidentialité, sécurité, intégrité des données médicales informatisées et protection des individus
    • Intervenant : Aude Bonnard (avocate, barreau de Lyon, Ordre des médecins du Rhône)
      Contenu : Accès vers les données médicales. Gestion et protection des données médicales, stockage des données (lois, durée, etc.)
    • Conception et modélisation de Systèmes d'information Médicaux
    • Intervenant : Timothé Bonhoure (doctorant, INSA Lyon, LIRIS)
      Contenu : Conception, Modélisation OO, Introduction au langage UML. IHM : Fondements, concepts et web sémantique.
    • Dossier médical patient
    • Intervenant : Timothé Bonhoure (doctorant, INSA Lyon, LIRIS)
      Contenu : Application au Dossier médical Patient : Standard HL7 et présentation du DMP
    • Sécurité des Systèmes d'Information médicaux
    • Intervenant : Timothé Bonhoure (doctorant, INSA Lyon, LIRIS)
      Contenu : Introduction aux exigences fondamentales de la sécurité/les menaces et risques actuels visant les systèmes d'information
      Objectif : Concepts et techniques de base de la cryptographie. Comprendre les technologies actuelles de protection des systèmes d'information