Master 1 Recherche Biomédicale - UE RB14
Informatique Médicale et Technologies de Communication (9 ECTS)


Description générale de l'UE

Équipe pédagogique :

  • Responsable de l'UE : Florence Zara (LIRIS-SAARA, Lyon 1)
  • Intervenants de cours : A. Bonnard, P. Clarysse, M. Ducret, C. Ghedira Guegan, J. Matout, N. Noury, G. Talens, E. Reynaud, F. Zara.

  • Conditions d'accès à l'UE : Etudiants à partir de la 2ème année des études de Santé.
    Modalité d'inscription : Inscription par internet sur le site applicationbh.univ-lyon1.fr.
    Volume horaire : 76h

    Objectif de l'UE

    Familiariser les étudiants à la discipline de l'Informatique en apportant dans un premier temps, les connaissances de base sur l'architecture des ordinateurs, le réseau, Internet et la programmation, afin dans un second temps, d'appréhender l'utilisation des nouvelles technologies dans le domaine médical.


    Thématiques abordées

    • Notion de bases en informatique
    • Programmation
    • Apport de la Réalité Virtuelle dans le domaine médical
    • Apport de l'Intelligence Artificielle dans le domaine médical
    • Télémédecine, e-santé : apport et limites
    • Traitement et analyse d'images
    • Méthodes de traitement des signaux physiologiques
    • Création de base de données
    • Création de pages Web
    • Conception et modélisation de Systémes d'information Médicaux
    • Sécurité des Systèmes d'Information médicaux
    • Dossier médical patient
    • Cas pratique : utilisation des technologies numériques en odontologie
    • Aspects légaux liés à la confidentialité, sécurité, intégrité des données médicales informatisées et protection des individus

    Cette UE peut être liée à l'UE RB25 de stage d'initiation à la recherche.

    Les étudiants inscrits en RB14 peuvent faire en plus un stage RB25 en informatique médicale, de 6 crédits ECTS. Ce stage consiste à faire une revue bibliographique d'environ 10 articles publiés dans des revues à comité de lecture sur un sujet de leur choix en informatique médicale. Ces articles sont fournis par leur maitre de stage, qui est l'un des intervenants de leur choix de l'UE RB14 ; l'étudiant peut également proposer des articles. Le stage est validé fin juin par une note >= 10/20 d'un article de synthèse des articles étudiés (article de type "revue de la littérature" de 8 à 10 pages) et de la présentation orale de 15 mn de cette synthèse devant un jury composé de 3 personnes (Maitre de stage, un autre Intervenant de l'UE RB14, Responsable de l'UE RB14).


    Modalités de contrôle des connaissances (MCC)

    • Coefficient : 40% TP-TD, 60% examen papier
    • Date de l'évaluation : jeudi ?? 2020 -

    Emploi du temps - année universitaire 2019-2020

    Horaire : Jeudi 14h-18h
    Faute d'un assez grand nombre d'inscriptions, l'UE RB14 sera fermée durant l'année 2019-2020.

    Description des enseignements de l'UE RB 14

    • Notion de bases en informatique
    • Intervenant : Florence Zara (MCU, Lyon 1, LIRIS).
      Contenu : Architecture d'un ordinateur, réseau, web.
      Objectif : apportez aux étudiants les notions de bases en Informatique (réseau, architecture, www) pour mieux appréhender les autres enseignements de l'UE.
    • Programmation
    • Intervenant : Florence Zara (MCU, Lyon 1, LIRIS)
      Contenu : De l'idée à la conception d'une application : partir d'un problème, réflexion pour le résoudre, algorithmes qui en découlent, langages de programmation pour traduire l'algorithme, pourquoi plusieurs langages de programmation (C++, Java, JavaScript, etc.). Exercices de programmation simples
      Objectif : que les étudiants sachent ce que c'est qu'un programme, comprennent comment cela s'implémente, et qu'ils sachent qu'il y a derrière (BD, calcul, affichage via navigateur/smartphone/tablette).
    • Apport de la Réalité Virtuelle (RV) dans le domaine médical
    • Intervenant : Florence Zara (MCU, Lyon 1, LIRIS)
      Contenu : Etat de l'art de l'existant (logiciels, dispositifs de RV simulateurs), technologie actuelle, piste pour l'avenir.
      Objectif : savoir ce que la RV peut apporter au domaine médical, comprendre comment sont conçus les systèmes basés sur la RV.
      Slides du cours : (1pp) (6pp)
    • Apport de l'Intelligence Artificielle (IA) dans le domaine médical
    • Intervenant : Emanuelle Reynaud (MCU, Lyon 2, EMC)
      Contenu : "Deep Learning" et applications en santé.
      Objectif : savoir ce que l'IA peut apporter au domaine médical, savoir ce qu'il y a réellement derrière le mot IA.
      Notions en "deep Learning" et réseaux de Neurones artificiels. Illustrations avec des applications dans le domaine de la santé : détection des cancers du sein, l'aide au diagnostic, la détection des signes précoces de maladies neuro-dégénératives.
    • Télémédecine, e-santé : apport et limites
    • Intervenant : Norbert Noury (PR Lyon 1, INL)
      Contenu :
      Objectif :
    • Traitement et anaylse d'images.
    • Intervenant : Patrick Clarysse (DR CNRS, CREATIS)
      Contenu : Notions de base et notions plus avancées (techniques d'apprentissage) de traitement et d'analyse médicales
      Objectif : Le travail pratique porte sur la mise en œuvre des techniques de traitement vues en cours.
    • Création de base de données
    • Intervenant : Guilaine Talens (MCU Lyon 3, IAE)
      Contenu : Conception globale d'une BD. Qu'est-ce qui se passe derrière ? Requêtes, faire des statistiques sur des données. Finalisation applications. Modélisation d'une base de données, requêtes en SQL.
    • Création de pages Web
    • Intervenant : Guilaine Talens (MCU Lyon 3, IAE)
      Contenu : Conception générale d'un site web, qu'est-ce qu'il y a derrière un click sur un site web ? lien avec BD (PHP). Faire un site Web en groupe.
    • Utilisation des technologies numériques en odontologie
    • Intervenant : Maxime Ducret (MCU-PH odontologie)
      Contenu : CFAO, empreinte optique, impression 3D en odontologie
    • Méthodes de traitement des signaux physiologiques
    • Intervenant : Jérémie Mattout (CR INSERM, CRNL)
      Contenu :
      Objectif :
    • Aspects légaux liés à la confidentialité, sécurité, intégrité des données médicales informatisées et protection des individus
    • Intervenant : Aude Bonnard (avocate, barreau de Lyon, Ordre des médecins du Rhône)
      Contenu :
      Accès vers les données médicales. Gestion et protection des données médicales, stockage des données (lois, durée, etc.)
    • Conception et modélisation de Systèmes d'information Médicaux
    • Intervenant : Chirine Ghedira Guegan (PR, IAE Lyon 3, LIRIS)
      Contenu : Conception, Modélisation OO, Introduction au langage UML. IHM : Fondements, concepts et web sémantique.
    • Dossier médical patient
    • Intervenant : Chirine Ghedira Guegan (PR, IAE Lyon 3, LIRIS)
      Contenu : Application au Dossier médical Patient : Standard HL7 et présentation du DMP
    • Sécurité des Systèmes d'Information médicaux
    • Intervenant : Chirine Ghedira Guegan (PR, IAE Lyon 3, LIRIS)
      Contenu : Introduction aux exigences fondamentales de la sécurité/les menaces et risques actuels visant les systèmes d'information
      Objectif : Concepts et techniques de base de la cryptographie. Comprendre les technologies actuelles de protection des systèmes d'information